Vyšetření ATPO má diagnostický a prognostický význam u autoimunních thyreoitid. Vyšetřování hladin autoprotilátek má diagnostický a prognostický význam. Protilátky proti štítné žláze jsou přítomny v séru u 80 - 90% autoimunních thyreoitid. U Gravesovy - Basedowovy choroby má stanovení protilátek velký význam pro diferenciální diagnostiku a kontrolu terapie. U pacientů vyšších věkových kategorií je možno zjistit přítomnost autoprotilátek bez klinických příznaků onemocnění.